鳳山祖廟位于灌口鎮(zhèn)灌口街北側(cè)，始建于明朝啟禎年間。該廟原為兩落宮殿式結(jié)構(gòu)的建筑物，幾經(jīng)歷代重修。現(xiàn)在前殿是由海峽兩岸信徒集資，按清乾隆丙午年（公元1786年）式樣修葺一新；并留有一堵乾隆丙午年修建的青石窗雕及盤龍石柱，青石獅及石柱楹聯(lián)原物。楹聯(lián)都是前清時(shí)期同安的舉人，太學(xué)生所書，作對(duì)工整，書法技藝精湛。后殿是民國十八年（公元1929年）由仰光同安縣仁里公會(huì)捐建混凝鋼筋建筑，廟內(nèi)祀奉李府清元真君二郎神，其中殿的八幅青石窗雕記載著該神的來歷。青石窗雕描畫著孽蛟興風(fēng)作浪，一老一少正與孽蛟搏斗；后江上風(fēng)平浪靜，祥云朵朵，一老一少駕著被馴服的蛟龍，迎著彩云，冉冉上天。二郎神是中國民間神話中的水神。據(jù)《中國宗教祠典》釋：二郎神系指戰(zhàn)國時(shí)代秦蜀郡守李冰三次子，因“除蜀郡都江之孽蛟，有水功”后人遂在今四川灌縣立廟紀(jì)念。宋真宗時(shí)追封為“清云妙道真君”。

灌口鳳山祖屆與臺(tái)灣、海外淵源關(guān)系密切。明末清初，灌口是鄭成功反清復(fù)明基地之一鄭成功收復(fù)臺(tái)灣時(shí)其將鳳廟香火請(qǐng)至臺(tái)灣。目前，臺(tái)灣祀奉灌口鳳山廟香火的廟宇有一百六十余座。旅居南洋各地的灌口人又把灌口鳳山廟香火帶到旅居地，現(xiàn)在東南亞一些國家和地區(qū)，如緬甸仰光、馬來西亞檳城、印尼三寶垅、泰國曼谷等都有灌口鳳山廟的分爐。

現(xiàn)在灌口鳳山廟經(jīng)海內(nèi)外信徒捐資維修，已修葺一新，溢彩流光，金壁輝煌。“大使?jié)砷L俎豆南?？慈f里，真君名重光風(fēng)海峽借千秋”是灌口鳳山廟與臺(tái)灣海外關(guān)系淵源遠(yuǎn)流長的真切寫照。